Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms