Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms