Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms