Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdpd3Q99LY2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms