Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nmd3Q99L48 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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