Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlcd1Q99JT6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlcd1Q99JT6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms