Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms