Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms