Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms