Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Odf3Q920N1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Odf3Q920N1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Odf3Q920N1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Odf3Q920N1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Odf3Q920N1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Odf3Q920N1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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