Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms