Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdha8Q91Y12 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms