Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx15Q91WE1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx15Q91WE1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms