Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms