Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx1Q91V10 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms