Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms