Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps4aQ8VEJ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms