Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8VDP2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms