Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc92Q8VDN4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc92Q8VDN4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms