Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgtbQ8VD33 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms