Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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