Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R3C1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8R3C1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R3C1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q8R3C1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8R3C1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q8R3C1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R3C1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R3C1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R3C1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms