Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cdc16Q8R349 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cdc16Q8R349 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cdc16Q8R349 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cdc16Q8R349 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cdc16Q8R349 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc16Q8R349 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Cdc16Q8R349 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cdc16Q8R349 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cdc16Q8R349 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cdc16Q8R349 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cdc16Q8R349 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cdc16Q8R349 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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