Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubqln1Q8R317 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ubqln1Q8R317 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms