Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcsapQ8QZT2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms