Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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