Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot6Q8K3P5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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