Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms