Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms