Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms