Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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Trappc12Q8K2L8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Trappc12Q8K2L8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Trappc12Q8K2L8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Trappc12Q8K2L8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Trappc12Q8K2L8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Trappc12Q8K2L8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Trappc12Q8K2L8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Trappc12Q8K2L8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms