Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms