Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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