Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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