Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms