Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms