Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp10Q8CIE4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Parp10Q8CIE4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms