Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rab11fip3Q8CHD8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rab11fip3Q8CHD8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rab11fip3Q8CHD8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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