Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ercc8Q8CFD5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ercc8Q8CFD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ercc8Q8CFD5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ercc8Q8CFD5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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