Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms