Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkiras1Q8CEC5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms