Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms