Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrif1Q8CDD9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrif1Q8CDD9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrif1Q8CDD9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrif1Q8CDD9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrif1Q8CDD9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrif1Q8CDD9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrif1Q8CDD9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrif1Q8CDD9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrif1Q8CDD9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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