Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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