Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vwa8Q8CC88 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms