Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms