Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms