Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5S3

Uncharacterized protein C3orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5S3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5S3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms