Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms