Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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